2010年1至5月份，舟山检验检疫局植物疫情检出数量占到了浙江验检疫局总数的82%；封存来自疫区肉类99280公斤，蔬菜水果类47386公斤；共截获医学媒介生物67批次。为更好了落实全国进出境动植物检验检疫工作会议精神，落实国家局和浙江检验检疫局领导“三个提升”的总体要求，舟山检验检疫局六条措施，积极构建卓有成效的口岸植物检疫防控体系。
一是加强合作，提高了对交通运输工具的检疫把关力度。根据局分工，卫检处对船检中动植物及产品进行在现场检疫，动植检处利用实验室设备和人员上的优势，对卫检处采集样品中的有害生物进行鉴定工作，并不定期开展交流，就如何提高采样效率及针对性、样品鉴定和两部门协作方式进行深入的探讨。1-5月，截获疫情41批次，发现检疫性有害生物11批次，其中四纹豆象5批次，鹰嘴豆象3批次，菜豆象3批次。此外，首次在入境船舶中截获简单异尖线虫，这也是浙江口岸首次在入境船舶中发现该类病害，具有重要公共卫生学意义，提高了对交通运输工具的检疫把关力度。
二是重视检测工作水平的提高，有害生物鉴定能力再获突破。在全体检疫人员的共同努力下，2010年舟山检验检疫局有害生物截获工作又向前迈进了一步：国家总局101号公告发布之后全国油菜主产区首次截获检疫性有害生物油菜茎基溃疡病。
三是积极开展对外交流，建立科研创新的防控平台。以综合实验室建设为平台，积极开展植物疫情相关研究；实现走出去战略，推动疫情防控网络化和信息共享。舟山动植检实验室在上海检验检疫局、江苏检验检疫局等五个实验室同时进行的检测中，第一个用PCR技术检出该病，又第一个分离到毒株，从技术中保证了全国首批54304.240吨，价值2600万美元的油菜籽顺利地进行了退货转港处理，确保了我国油菜主产区的安全，同时为我国国储油菜籽的顺价销售和保护我国农民种植油料作物的积极性作出了贡献，受到浙江检验检疫局和国家局动植司领导的肯定；国内首次截获有害生物纹虎天牛，浙江检验检疫系统首次截获检疫性有害生物烟草环斑病毒、大豆北方茎溃疡病菌、假苍耳和一般性有害生物蒺藜、宾州蓼等，植物检疫鉴定能力进一步提高；通过加强入境集装箱的检疫监督力度，共从集装箱中截获有害生物38批次。
四是研究疫情检出特点，积极探索进境敏感植物产品监管新模式。舟山检验检疫局高度重视疫情检出特点分析， 1-5月舟山检验检疫局共检出各类有害生物1428批次, 比去年同期增长27.05%，有害生物截获数量创历史新高，再度刷新了舟山检验检疫局外来有害生物截获的历史。通过疫情分析中暴露出的工作薄弱环节，找出工作重点，对疫情高发品种的粮谷类检疫和敏感品种水果检疫实行双人双处室上岗，保证工作质量和廉政建设的双重需要。
五是全面建立分类管理体系，疫情防控与对外贸易便利化两促进。舟山检验检疫局在防控工作上积极推进“信息化+企业诚信+风险评估分类管理”制度，指导企业建立和完善质量安全自查自控标准，加强日常监管力度与企业诚信管理，提高监管工作的有效性与疫情检出率。同时修订完善业务例会制度，由主管局长主持，及时研究分析最新疫情动态和存在的问题，提出合理化建议，为企业提供有效的咨询与帮助。
六是结合绩效考核与质量管理体进专业技术人员队伍建设。全力保证专业技术人员的投入，明确疫情上报主要负责部门和协作部门的职责，在全局绩效考核与管理体系中加大检出疫情的加分分值。同时，广泛开展业务培训与大练兵活动，利用木质包装线虫检疫实验室的优势，组织了进境木质包装检疫实验室部分的实战演练比赛，以赛促训、提高能力。
七是全力做好船舶检疫查验工作。上半年舟山检验检疫局卫检处共检疫查验出入境（港）船舶1679艘次，与去年同期比较增加14.8%，其中入境（港）船舶740艘次（包括协作数据），出境（港）939艘次；检疫查验交通工具员工及旅客33707人次；封存来自疫区肉类
今年1-5月舟山检验检疫局共检出各类有害生物1428批次, 比去年同期增长27.05%，有害生物截获数量创历史新高，再度刷新了舟山检验检疫局外来有害生物截获的历史。其中油菜茎基溃疡病、菜豆荚斑驳病毒、大豆北方茎溃疡病、假高粱、豚草、三裂叶豚草、刺蒺藜草、四纹豆象、苍耳（非中国种）、窄几丁（非中国种）、鹰嘴豆象等检疫性有害生物17种，191批次。
去年，全年在进境动植物检疫中共截获有害生物2897批次，比去年同期增长18.4%，其中截获检疫性有害生物382批次、20种，分别比去年同期增长46.4%和54.0%。无论是截获总量还是检疫性有害生物截获量均再度刷新舟山检验检疫局外来有害生物截获的历史，以截获检疫性有害生物种类最多、截获检疫性有害生物次数最多、截获有害生物种类最多、截获有害生物次数最多继续保持全系统领先地位。
2009年，总局在全系统首次试行植物疫情截获评价指标体系来综合评判各直属局在植物疫情截获方面的工作成效，省局参照总局的评价体系，对2009年各分支局工作进行了综合评价，舟山检验检疫局的平均截获率为262.630%，高出第二名的13.65倍。
