全球金融危机、人民币持续升值等不利因素给造船业带来了一定影响。上海海关以海关总署“建立特殊行业保税加工监管模式”项目改革为突破口，对造船业实施便捷有效的管理新模式，有力推动了上海造船业的发展，缓解了企业的困境。2009年全年，上海关区出口各类船舶价值66.5亿美元，同比增长52.1%。其中，12月份出口额再创入世以来新高，达8.2亿美元，同比激增1.5倍。
 
    为配合落实国务院《船舶工业调整振兴规划》》，上海浦东海关还适时推出了一系列有效举措：引导船舶行业企业承担保税物料管理责任，充分发挥其管理主动性，在此基础上海关实施诚信管理；实施“电子底帐＋企业自核”模式，允许企业在每期报核前以实际耗用量办理单耗的申报手续，海关认为必要时，根据企业自聘的、海关认可的社会中介机构出具的审计报告，在审核确认保税加工企业经营活动真实性、合法性后免于核查。此外，海关还与部分造船企业签订了新型合作伙伴关系意见书。通过合作备忘录的形式，明确双方职责，在企业规范自身进出口行为的前提下，海关予以相关便利措施，促进企业发展。