福建检验检疫局辖区特有的对外开放口岸多（10个一类口岸）、对台小额贸易点多（24个）、台轮停泊点多（29个）的“三多”形象，决定了入境旅客携带物、邮寄进境物、进境船舶这三项检疫任务，成为这次防控输入型甲型H1N1流感工作的重要一环。面对近来疫情越来越严重，发生越来越广泛，流行越来越快速的形势，福建局专门成立的防控甲型H1N1流感领导机构中的“查禁与处理组”，坚持“三强化”抓好防控工作,成效显著。
    一是强化措施的严密性，不给防控工作留空档。实行24小时视频监控，确保对来自疫区的入境旅客携带物、进境邮寄物100%过X光机查验；对疫区进境船舶和船上猪及其制品分别做到100%登轮查验和封存；对来自疫区运输工具厨房、储藏室、食品舱、货舱等重点区域和动植物性废弃物100%作消毒和无害化处理。截至6月底，已查验进境旅客携带物7.3万件，截获禁止进境动植物产品1150千克，其中猪及其产品237千克；查验进境邮寄物4.1万件，截获禁止进境动植物产品44.8千克，其中猪及其产品19.1千克；查验进境运输工具1941架/艘，查获、封存猪及其产品5.7吨。
    二是强化联防联控的可靠性，不给对台小额贸易点和台轮停泊点的防控留遗憾。与边防大队、边防派出所、海事部门、台办、管委会及对台小额贸易公司建立工作密切互动机制，派人驻点边防派出所，严格联防联控，严格入境检疫申报，严格船舶检疫处理，严格船上人员上下船登记。自防控以来，实施台轮检疫660艘次，无一遗漏，确保这一特殊区域的防控工作不留遗憾。
    三是强化督导督查的严肃性，始终保持防控工作的可追溯性。坚持做到“每日一报告，每周一分析，每周一总结”制度，详尽记载工作日志、疫情动态、工作措施、工作进展、问题整改落实情况等，在防控工作进行2个多月里，相关工作无一间断，各项记录清晰明了，确保防控过程的完整性和全程工作的可追溯性。