6月16日，国家口岸管理办公室召开由公安部、海关总署、国家质检总局、铁道部、北京市口岸办和上海市口岸办等有关部门参加的协调会议，研究解决两站（北京西站、上海站）两车（京港直通车、沪港直通车）的奥运安保问题。国家口岸办公室罗文金副主任主持会议。会议认真分析了“两站两车”奥运安保工作的严峻形势，提出了落实“平安奥运行动”目标的具体措施，出台了《北京西站和上海站临时口岸奥运安保联络协调机制方案》（国岸发【2008】21号），建立了由四部委（公安部、海关总署、国家质检总局、铁道部）和北京市口岸办、上海市口岸办共同组成的临时口岸突发事件应急处理联络协调机制，同时确定由地方口岸办公室牵头建立临时口岸执行层面的2级联络协调机制。

根据国岸发【2008】21号文件精神，北京市人民政府口岸办公室随即召开了北京西站临时口岸2级联络协调机制会议，北京出入境边防检查总站、北京海关、北京出入境检验检疫局、北京铁路局、广东铁路集团公司、北京西站的主要负责同志参加了此次会议。会议议定了北京西站临时口岸2级联络协调机制（局级单位）及其办公室（西站现场单位）成员单位和主要职责，并于7月11日进行了应急预案实战演练，通过演练检验了检疫、边检、海关、铁路各单位在各自执行应急预案的基础上相互衔接、形成合力的能力。