5月13日，为组织好向四川汶川地震灾区运送救灾物资的保障工作，上海机场集团成立了以集团公司副总裁汪光弟为组长的抗震救灾领导小组，全面组织和协调机场集团的抗震救灾工作。同时，为了保证救灾物资和救援人员在机场的快速通行，机场集团主动协调相关单位，落实责任单位，在保证安全的前提下，给救灾人员和物资开辟专门通道，确保人员和物资的快速通行和顺利起运。

  5月14日凌晨4点，市公安局紧急抽调的600名公安特警和消防官兵携带应急抢险工具和破拆专用器材等，分别乘坐MU7020、7022、7024三架包机赶赴汶川灾区。浦东机场安检在安全压力大、空防任务重的情况下，立即启动特殊任务保障方案，为救援物资、救援人员开通绿色通道，保证消防武警官兵、特种警察、医疗队等各类救援人员以及各项救援物资安全、迅速过检登机，尽快抵达灾区。据统计，截至14日上午9时，共为救援人员673人（其中消防官兵450人，特种警察200人），各类救灾物资753箱进行了安检。同时为保证救灾物资运输安全，机场安检还主动为各类救灾物资提供打包服务。浦东机场运行指挥中心及时与空管联系，优先给予满载救灾专业人员的航班优先放行。据统计，截至15日上午，浦东机场共保障运送救灾物资、人员的专包机16架次。

5月14日，上海首批赶赴四川省地震灾区的医疗救援队在虹桥机场整装待发。此次上海市医疗救援队共由来自上海医疗卫生系统的6支队伍共114人组成，并同机运送5吨医疗器械，分赴四川省成都开展医疗救护工作。虹桥机场专门开辟了由上海至成都的MU7001包机航线运送医疗救援队；安检部门在确保空防安全的前提下，按照“特事特办、简化程序、优先放行”的原则，特别在17号贵宾厅增加一条安检通道，抽调部分安检人员确保医疗救援队成员迅速通过安检。此外，5月14日凌晨2：30和4：30，虹桥机场接到来自地震灾区成都和绵阳的MU5012、9C8810次航班将在虹桥机场降落的通报后，虹桥机场克服夜间施工等诸多困难，保证了机场24小时开放，并优先安排两个机位供航班进港，确保机上400余名乘客返回上海，为帮助地震灾区疏散旅客提供了支持。