今年是厦门机场迎来两岸春节包机的第二年，为既方便乘坐两岸包机的台胞快速通过检验检疫查验通道，又有效防控传染病，厦门检验检疫局在总结2006年两岸春节、中秋包机查验经验的基础上，在全国空港口岸率先推出新的检验检疫申报制度：在正常状态下，乘坐两岸包机的出入境台胞可免填写《出/入境健康申明卡》；但有疾病症状的人员、两周内接触过传染病人或染疫动物或病禽畜的人员、两周内到过传染病流行区的人员需要主动申报健康状况、填写健康申明卡及接受检疫。与此同时，该局还制定了相应的预案，抽调有经验的医师加强旅检现场的医学巡查；设置两岸春节包机旅客检验检疫专用通道；使用全角度的电子视频监控和多点智能红外体温快速检测；启用检疫犬实施旅客携带物的检疫；在通道明显处张贴《乘坐两岸包机旅客注意事项》宣传材料等。
这项新的申报制度，自今年2月1日在厦金航线试行以来，基本实现了出入境旅客“通检零待时”，收到了很好的效果。