2006年度，北京各口岸运行情况良好，多数指标均创历史新高。1-12月份,口岸进出境旅客及员工共1260.92万人次，同比增长18.3％。海关监管进出口货物共109.11万吨，同比增长17.79％，其中监管进口货物85.19万吨，同比增长16.95％，监管出口货物23.92万吨，同比增长20.93％；征收关税及代征税共279.27亿元（仅指口岸数），同比增长35.5％；检验检疫44992批次，价值金额147411万美元。
        北京首都国际机场空港口岸各项指标均有大幅度增长，都创历史新高。旅客吞吐量接近5000万人次，达到了4865.48万人次，同比增长18.66%；进出境旅客1260.92万人次，同比增长18.3%（其中：外籍旅客701.97万人次，同比增长14.51%）；飞机起降架次37.66万架次，同比增长10.23%（其中：国际航班8.79万架次，同比增长14.8%）；海关税收199.67亿元，同比增长40.81%；货邮103万吨，同比增长31.7%。
        北京朝阳口岸运行情况良好。监管货物与征收关税及代征税也创历史新高，征收关说及代征税达到79亿元，同比增长23.89%；监管货物9.3万标箱，同比增长8.82%。
        北京丰台货运口岸运行情况平稳。各项指标均有大幅增长，监管货物4.48万吨，同比增长72.31%，征税关税及代征税0.47亿元，同比增长9.07%。