2006年，上港集团在上海市委、市政府和国资委的正确领导下，在各口岸、政府部门，以及船公司、货主的大力支持下，紧紧围绕上海国际航运中心建设这一宏伟目标，坚持科学发展观，不断深化改革，开拓创新，较好地完成了全年各项任务，创造了集装箱吞吐量、货物吞吐量，外贸吞吐量等多项历史最高纪录。据快速统计，全年上港集团完成集装箱吞吐量2171万标准箱，比上年增长20.1%，净增363万标准箱，绝对增量为历史最高；支持、配合船公司新开35条集装箱国际班轮航线，其中远洋25条；航班密度达到2106班/月，比上年增加139班/月。全年货物吞吐量完成3.03亿吨，首次突破3亿吨大关，比上年增长13.2%；外贸吞吐量完成1.92亿吨，比上年增长16%；其中外贸进口完成9210万吨，外贸出口首次达到1亿吨，比上年分别增长8.6%和23.9%。一年来，洋山一期码头成熟运作，全年完成集装箱吞吐量323万标准箱，超额完成年度300万标准箱的计划任务，日均达到8849标准箱。