2006年12月28日上午，在合肥骆岗机场举行了安徽省公安厅机场公安局成立暨揭牌仪式，民航安徽机场公安局及其直属的黄山机场公安分局正式更名为“安徽省公安厅机场公安局”，并整建制移交安徽省公安厅管理。

        安徽省公安厅机场公安局的成立是根据民航体制改革和民航公安体制改革的总体要求，按照政企分开和精简、统一、效能的原则，进一步理顺安徽民航机场公安管理体制，规范和强化机场公安执法职能和空防安全管理职能。安徽省公安厅机场公安局将作为安徽省公安厅派驻机场的二级机构，党政领导关系隶属于安徽省公安厅，同时接受民航总局公安局的业务指导，其主要职责是防范和打击劫机、炸机等危及民航安全的各类违法犯罪活动，维护机场治安秩序和交通秩序，负责做好专机警卫工作。
        安徽省民航公安机构组建于1981年，相继更名为民航安徽省管理局公安处、民航安徽机场公安局，既是民航的一个隶属机构，又是公安部门的派出机关。此次改革前，党政领导关系隶属于安徽民航机场集团有限公司，业务上受民航总局公安局和安徽省公安厅双重领导。