据温州港务集团统计，截止11月28日，温州港集装箱吞吐量首次突破25万标准箱，达到250342标准箱，比去年同期增长22.98%，创历史同期最好水平。其中11月份完成30366标准箱，也是温州港单月集装箱吞吐量之最。
“十一五”期间，温州港务集团将逐步实施“老港换新港”方案，以适应温州城市建设和港口东移的趋势，为温州港从“瓯江时代”向“东海时代”跨越做好准备。2006年是“老港换新港”方案实施的第一年，温州港务集团对下属各港区的业务结构进行了较大程度的整和，吸收上港集箱资金成立温州港首个合资码头企业——温州金洋集装箱码头有限公司，3月份外贸内支线迁入水深和机械条件更好的七里港区，同时积极开辟新航线，增加航班密度，增加大型机械投入，主动上门营销，这些都在一定程度上增加了温州港的集装箱吞吐量。