为保证我国港口履约工作能够按照《SOLAS公约》要求顺利开展下去，维护港口设施安全，保障我国经济和对外贸易的平稳发展，参照国外港口的做法，4月10日，交通部、国家发展和改革委员会发布《关于收取港口设施保安费的通知》，决定自2006年6月1日起，在我国对外开放港口开始收取港口设施保安费。具体规定如下：

一、凡取得有效《港口设施保安符合证书》的港口设施经营人，对进出对外开放港口的外贸进出口货物（含集装箱）收取港口设施保安费。

二、港口设施保安费按下列标准收取：

（一）外贸进出口集装箱：20英尺重箱每箱20元人民币，40英尺重箱每箱30元人民币，空箱（含商品箱）免收；

（二）集装箱以外的其他外贸进出口货物：每吨0.50元人民币。

三、进口化肥和《中华人民共和国交通部港口收费规则（外贸部分）》中规定免征货物港务费的货物免收港口设施保安费。

四、港口设施保安费应当全部专项用于为履行《SOLAS公约》和《ISPS规则》所进行的港口保安设施的建设、维护和管理。

港口设施保安费的收费执行期限暂定为3年，自2006年6月1日至2009年5月31日。交通部还将专门制定港口设施保安费的收取和使用方法。