2006年3月23日，根据国家和省政府关于对口岸联检楼建设的有关规定和要求，由省商务厅（口岸办）牵头，省发改委、省外办、昆明海关、云南出入境检验检疫局、云南省公安边防总队等单位派员参加组成省联合验收组，会同红河州人民政府、金平县人民政府和相关单位的领导，共同对金水河口岸联检楼建设工程的使用功能进行了验收。通过逐一检查验收，联合验收组认为联检楼的使用功能建设基本合理，能满足口岸查验部门工作的需要，基本符合人员、货物、交通工具出入口岸通关要求，同意通过验收,正式投入使用。

金水河口岸联检楼工程是云南省边境口岸重点建设工程之一，工程项目2003年经省发改委批准立项建设，由金平县人民政府具体组织实施。联检楼位于金水河口岸规划区内，距口岸中越友谊桥中方一侧约50米处地域，总建筑面积2717平方米，总投资560万元。联检楼于2004年6月18日开工建设，2005年11月7日竣工并通过了工程质量的初验。口岸联检楼的投入使用，进一步提升了口岸功能，促进了“大通关”改革，推进了边疆口岸经济的发展。

金水河口岸位于金平县金水河镇，地处金水河、藤条河交汇处，与越南国际口岸马鹿塘对接。口岸距金平县城38公里，距越南莱州省会莱州市50公里，至奠边府省195公里，河内450公里，距老挝边境口岸西庄231公里，是通向越南莱州、奠边府、河内等重要城市及进入老挝边境的重要口岸。目前金水河口岸已完成口岸经济区的规划，越南马鹿塘口岸正在进行口岸经济区的建设，规划面积为43公顷。

金水河口岸于1954年12月17日正式开放。1978年口岸关闭。1992年6月金水河――马鹿塘的中越友谊桥修复。1993年11月10日经国务院批准口岸恢复开通。