为适应2008年奥运会边防检查工作需要，加强队伍建设，确保口岸安全畅通，根据公安部出入境管理局要求，北京出入境边防检查总站于近期对内设基层机构和职能进行调整。

此次机构调整涉及基层十二个单位的撤销与合并，新成立了特殊勤务检查队，主要负责对专机、包机、公务机、货机、调机等出入境飞机及其载运的人员的边防检查等工作。此次机构调整是北京总站自1998年职改以来规模最大、涉及人数最多的一次重大调整工作，在总站机构设置、人员编制、职能区分、管理模式和勤务组织等各方面都进行了较大的调整。通过调整减少了职能任务交叉，提高了人力资源利用率，明确了职责与权限，优化了领导干部队伍结构。北京总站将以此次机构调整为契机，以“新机构、高起点、齐奋进、创一流”为工作原则，与时俱进，以崭新的精神风貌、饱满的工作热情和昂扬的斗志投入到工作之中，真正把北京总站打造成“第一国门”、“文明国家的窗口”和“最优秀的行政执法队伍”。