跨地区铁路通道包括：连通南北的洛湛通道和连通西北与西南的兰渝铁路，并新建向塘至湄洲湾铁路，形成连通东南沿海与中西部地区的新通道；推进浙赣铁路提速电化工程建设，昆明至六盘水铁路增建二线，强化上海至昆明的运输能力；新建宁波经温州、福州、厦门至深圳铁路，铜陵至九江铁路、南京至合肥至武汉铁路，构成连通川渝、江汉、长三角、珠三角等地区的快速铁路通道。
根据交通部组织泛珠三角9省区交通厅共同制定的《泛珠江三角洲区域合作公路水路交通规划纲要》，到2010年，交通部将重点建设珠三角向外辐射通道、次核心区域间的通道、沿海港口快速集疏通道、重要公路口岸通道、珠三角城际高速及高速公路联网收费系统，形成以广州为中心的有层次的公路交通网络。
在狭义的珠三角地区，广州将通过城际高速公路网络，在2小时间到达珠三角重要城市；对于珠三角周边次核心区域400至500公里的范围内的中心城市，广州将实现当日往返；对于800至1000公里范围内的中心城市，广州将实现当日到达。
根据规划，交通部还将重点对珠江流域航道、港口进行整治建设。到2010年基本建成珠江三角洲高等级航道网，提高西江航运干线的通过能力，实现珠江三角洲内河航运体系由适应内河运输向适应江海船运输的跨越。
据悉，铁道部将在泛珠三角地区建设武汉至广州、广州至深圳香港的铁路客运专线。
