在2008年两岸端午包机期间，浦东边检站精心组织勤务，克服人员少、任务重的困难，以严谨、细致的工作作风，热情、周到的服务态度，圆满完成了两岸端午包机检查任务。对浦东边检站服务两岸端午包机工作，如全时段开设“迟到免排”、“紧急救助”等特别举措，先后得到了中央电视台、中央人民广播电台、新华社、人民网、中国新闻社、中国网等7家中央媒体，上海电视台、东方广播电台、解放日报、文汇报、劳动报等39家上海及网络媒体的报道。

据统计，6月3日至6月15日，海峡两岸共有东航、上航、华航、华信、长荣等7个航空公司参与两岸端午包机飞行任务，该站共检查两岸端午包机28架次；检查出入境旅客5281人次；检查机组员工368人次。