一是促进厦金航线的和谐通关。采取了简化申报手续、优惠客轮的检疫消毒费、加强口岸电子监管等措施，促进厦金航线的发展。会同厦门市卫生局、厦门市红十字会签署《共建厦金航线“生命救助绿色通道”合作协议》，完善重急症台胞病患救助程序和办法。全年共检疫厦金直航客轮5695艘次，人员66.8万人次，对23名台胞患者提供了特别救助服务。
二是加快进口台湾水果的通关速度。制定了促进台湾水果常态化进口的12项检验检疫具体措施，促进台湾水果在大陆的销售。共检验检疫进口台湾水果37批、481吨、货值59万美元。
三是促进输往金门蔬菜的常态发展。对厦门蔬菜直供金门实施“提前报检、加班抽样、快速进行农残和病虫害检测、快速通关放行”，确保了厦门蔬菜顺利输往金门。自2006年1月25日首批厦门蔬菜直输金门以来，已检验检疫输往金门蔬菜18批、21个品种、重量214吨、货值4.8万美元。
四是推动对台小额贸易的发展。2006年，大嶝小额贸易市场业务发展迅速，产品类别已从600余种增加到近千种。对此，厦门局高度重视、有效应对，进一步简化对台小额贸易输入货物的申报手续，按进口的台湾食品不同的卫生安全状态施检，即对高风险敏感产品集中精力进行口岸监管，对低风险食品在小额贸易市场进行日常监督，最大限度促进便利通关。
五是做好“两门”航线包裹检验检疫工作。针对两门包裹直航业务试点工作，按照“同等优先、适当放宽”的原则，实行风险动态管理、随到随检、简化手续、方便往来等有效措施，确保直航包裹监管到位、快速通关。
六是方便台湾渔船自捕鱼输往厦门。按照总局便利台湾自捕鱼通关的意见，我局采取了设立报检专用窗口、优先办理报检手续、快速放行等措施，加快台湾自捕水产品的通关速度。截至目前，已有9批次、1408吨台湾自捕鱼从厦门口岸入境。
七是做好春节、中秋两岸包机的检验检疫工作。专门制定了两岸包机检验检疫工作方案，采取在旅检通道专门开辟2个“直航检疫专用通道”、“通检引导员”用普通话、闽南话指导台胞填写检疫申明卡，快速办理检疫手续，快速通检等服务措施，做到人员到位、预案到位、服务到位，为两岸包机直航提供优质服务。共检验检疫春节和中秋包机共36架次、旅客5318名、机组成员418人次。
八是不断改进对台服务工作。组织召开了厦门首次大规模对台检验检疫工作专题会议。会后出台了《服务海峡西岸经济区建设、促进对台往来检验检疫若干便利措施》，社会反映良好。
