2008年起，香菇、黑木耳、白木耳、蘑菇等四种厦门口岸主要出口食用菌（保鲜、干制、盐渍、冷冻），将全部实施种植基地备案，并严格实行凭供货证明报检制度，以确保产品质量。

    厦门检验检疫局从2007年1月开始，对输日食用菌实施基地备案制度。至2007年12月，厦门检区已有33家企业取得备案资格，备案基地生产产品涉及香菇、黑木耳等产品的数量已达到3,333.8万袋的总规模。出口种植基地备案在推进源头管理、保障出口质量安全上发挥了重要作用，也有力推动了对外出口。据统计，去年厦门出口食用菌2,429批，18,575吨，8,607.6万美元。