蛇口水运口岸由招商局蛇口工业区公司投资兴建，于1981年1月经国务院批复对外开放，是我国改革开放初期第一个由企业自筹资金建设、管理和经营的国家开放口岸，目前已发展成为集铁路、公路、水路等运输方式为一体的大型综合性的客货运港口口岸。蛇口口岸共有31个对外开放泊位，其中10个集装箱专用泊位。

　　蛇口水运口岸位于珠江口东岸、深圳市西部南头半岛南端。东临深圳湾，南与香港隔海相望，西邻珠海、澳门及深圳机场，北靠南山内陆腹地。陆路距深圳市区27公里；水路距香港22海里。陆路可与广深、广惠公路干道以及广深高速公路、平南铁路进而由广深线、广九线与国内衔接。

　　（1）招商港务（深圳）有限公司客货运码头。该码头拥有陆域面积75万平方米，岸线总长4100米（其中客运岸线1050米），是拥有35个客、货运泊位的中国沿海大型综合性港口，港口年货物通过能力2000万吨，集装箱100万标箱，客运500万人次，成为珠三角及华南地区重要的海上门户。

　　（2）蛇口集装箱码头。该码头建有10个泊位，其中，一期工程建设规模为2个集装箱专用泊位，年设计吞吐能力为100万标箱，于1991年8月建成投产，蛇口集装箱码头二、三期工程项目，于2001年上半年动工兴建，共建成8个集装箱专用泊位，其中二期工程2个集装箱专用泊位，已于2003年建成并投入使用，三期工程6个集装箱专用泊位于2010年3月前建成并陆续投入使用。

　　（3）太子湾邮轮母港。该邮轮母港是由招商局蛇口工业区控股有限公司于2011年12月正式动工建设。邮轮码头建设22万吨级邮轮泊位1个、10万吨级邮轮泊位1个，新建800吨级客轮泊位12个（其中港澳线泊位6个），2万吨级客货滚装泊位1个,共计15个泊位，其中8个对外开放泊位。蛇口邮轮中心大楼工程占地面积约4.26万平方米,总建设面积为13.8万平方米。出境大厅位于二层，边检出入境查验通道包括16条人工查验通道(出入各8条)和20条自助查验通道(出入各10条)。邮轮母港于2016年9月项目工程建设基本完工，于2016年10月11日通过由省口岸办牵头组织的对外开放前准备工作验收，2016年10月12日正式对外开放。2016年10月31日起蛇口客运码头搬迁至太子湾邮轮母港客运码头运作。2016年11月13日由云顶丽星邮轮旗下的“处女星号”完成首航，深圳-越南航线于2016年开通。

　　（4）香港友联船坞（深圳）有限公司专用码头。该码头为中外合资公司投资建设的，可为中外客商提供30万吨级的修船业务，是深圳市西部港区唯一的修船基地，目前建有4个泊位（其中2个干船坞、2个浮船坞）。目前孖洲岛修船专用码头运作正常， 2016年修船数量166艘（其中外国籍船舶147艘）。